住在天空与海洋辉映的城镇“藤泽”的梓川咲太，就读高中二年级。 　　他与既是学姐又是恋人的樱岛麻衣所度过的令人雀跃的日常，随着初恋对象牧之原翔子的出现而改变。 　　不知为何，存在着“中学生”和“大人”两个翔子。 　　出于无奈开始和翔子住在一起的咲太，受到“大人翔子”的捉弄，和麻衣的关系也变得尴尬。 　　此时，“中学生翔子”身患重病的事实被发现，咲太的伤痕开始隐隐作痛——。

故事以史上首个自律人型AI「Vivy」为主角，是以「歌声带给众人幸福」为使命的「歌姬」。某日自称来自100年后的AI「松本（マツモト）」突然出现，并表示自己将与Vivy共同修正历史、避免100年后人类与AI发生战争，使Vivy踏上破坏AI的旅途。

思春期症候群——这是一种只发生在易敏感和不稳定的青春期的、不可思议的现象。 　　例如，在梓川咲太面前出现的野生兔女郎。 　　她的真实身份是高中高年级学生，明星活动休止的女演员樱岛麻衣。她迷人的身姿，不知为何在周围的人眼里看不出来。 　　咲太决定解开这一谜题。在于麻衣一起度过的时间里，咲太知道了她秘密的想法…… 　　女主人公们一个接一个地出现于咲太的周围，她们都有着“青春期症候群”。在天空和大海都很闪耀的小镇上，开始了令人激动的故事。

西历5012年。突然入侵地球的＜外星人＞与其制造的＜机械生物＞导致人类面临灭亡危机。

特别篇 《吹响！上低音号～合奏比赛～》是《吹响！上低音号》系列时隔4年的续篇。预告片中描绘了久美子就任部长后迎来的第一个大工作，为参加合奏大赛而进行的校内选拔，并可以听到TRUE演唱的主题曲《合奏》的一部分。