1962年10月14日，一则由飞临古巴上空U-2侦察机所拍摄照片中透露的情报信息，引发了一场当时世界两大超级大国美国与苏联之间的空前危机。美国情报官员在这组情报资料中发现，苏联正在距离佛罗里达不到150公里的古巴首都哈瓦那西南的圣克利斯托瓦尔修建基地，部署中短程导弹和运 载核武器的伊尔-28重型轰炸机，这些导弹足以摧毁全美各大城市并且造成重大伤亡。全美上下陷入极度恐慌之中，也将整个世界推向了核灾难的边缘。总统约翰·肯尼迪（布鲁斯·格林伍德 Bruce Greenwood 饰）和其弟罗伯特·肯尼迪（斯蒂文·卡普Steven Culp 饰）沉着应对这场一触即发的核战危机，影片透过白宫高级特别助理肯尼斯·奥唐纳（凯文·科斯特纳 Kevin Costner 饰）之眼，再现了危机重重的惊天十三日。

未来某年的7月2日，美国各地的监视站发现一艘直径达数百英里的巨大飞船接近了地球。飞船发出的无线电信号干扰了地球的通信卫星信号，并放出了多艘直径达15英里的子飞船飞抵地球上各大城市的上空。外星飞船敌友未明，人们陷入了恐慌和迷惑。 　　电脑工程师戴维（杰夫?戈德布拉姆 饰）破译出外星人发出的无线电信号，其实是攻击的倒计时信号，他设法通知了前妻，总统的助理康妮，但是为时已晚，7月3日，外星人的飞船开始攻击地球，人类文明瞬间遭到巨大的打击和灾难。总统（比尔?普尔曼 饰）等人撤离到军事基地，指挥空军反击，却犹如以卵击石，毫无作用，军事基地也被摧毁，唯有飞行员史蒂文（威尔?史密斯 饰）设法诱使一架外星人战斗飞艇坠毁。 　　幸存者们逃到了秘密军事基地，在那里，科学家们一直在研究一艘50多年前坠毁的外星飞艇，致力于找出对付外星人的办法，那里也是人类最后的希望……

彼得（皮尔斯·布鲁斯南 Pierce Brosnan 饰）曾是一名CIA的特工，人称“十一月杀手”，他个性沉稳技艺高超，深受上司和同僚们的信赖。然而，彼得厌倦了整日打打杀杀东躲西藏的日子，他费了好大一番工夫，总算得以金盆洗手，只希望能够隐姓埋名，找一个谁也不认识他的地方，在平静中度过余生。　　然而天不遂人愿，一位名为爱丽丝（欧嘉·柯瑞兰寇 Olga Kurylenko 饰）女子出现在了彼得的生活中。爱丽丝手中掌握某些证据，直指数十年前的一个阴谋，此时她的生命正受到CIA的威胁，而曾经的这起阴谋，和彼得有着千丝万缕的关联。为了保护爱丽丝，彼得成为了老东家的对手，而CIA也不示弱，派出彼得过去的徒弟大卫（卢克·布雷西 Luke Bracey 饰）狙击两人。

未来某年的7月2日，美国各地的监视站发现一艘直径达数百英里的巨大飞船接近了地球。飞船发出的无线电信号干扰了地球的通信卫星信号，并放出了多艘直径达15英里的子飞船飞抵地球上各大城市的上空。外星飞船敌友未明，人们陷入了恐慌和迷惑。 　　电脑工程师戴维（杰夫?戈德布拉姆 饰）破译出外星人发出的无线电信号，其实是攻击的倒计时信号，他设法通知了前妻，总统的助理康妮，但是为时已晚，7月3日，外星人的飞船开始攻击地球，人类文明瞬间遭到巨大的打击和灾难。总统（比尔?普尔曼 饰）等人撤离到军事基地，指挥空军反击，却犹如以卵击石，毫无作用，军事基地也被摧毁，唯有飞行员史蒂文（威尔?史密斯 饰）设法诱使一架外星人战斗飞艇坠毁。 　　幸存者们逃到了秘密军事基地，在那里，科学家们一直在研究一艘50多年前坠毁的外星飞艇，致力于找出对付外星人的办法，那里也是人类最后的希望……

　　俄美两国策划一起反恐行动，派出特种部队擒获了掌握核武器的哈萨克王国独裁者伊万•雷迪克将军（Jurgen Prochnow 饰）。数周后的庆功宴上，曾为越战老兵的美国总统詹姆斯•马舍尔（哈里森•福特Harrison Ford 饰）针对恐怖分子和独裁政权发表了强硬而精彩的演说。莫斯科之旅圆满结束，总统一家及其政要乘空军一号返回美国，同行的还有艾格（加里•奥德曼 Gary Oldman 饰）带队的俄罗斯媒体工作人员。　　安全人员百密一疏，艾格的真实身份是效忠于雷迪克将军的恐怖分子。飞机起飞后，艾格和同伴们劫持飞机，绑架美国政要及总统家人，只有詹姆斯侥幸逃脱。恐怖分子要求俄美释放雷迪克将军，而藏身空军一号中的詹姆斯则和这群匪徒展开殊死决斗……