位于大陆中央的一个大国。那个国家皇帝的妃子们住的后宫中有一个少女，　　名字叫猫猫。　　之前在花街当药师，目前在后宫工作中。　　某日，她听闻皇帝的孩子们很短命的传言，现在的两个儿子都因病而日渐虚弱，出于兴趣猫猫开始调查这件事的原因，就像是在说不可能有这样的诅咒。　　美型的宦官——壬氏，安排猫猫去做皇帝宠妃的试毒者。　　虽然对人类没有兴趣，但出于对毒与药异常的执著，在花街长大的药师就这样被卷进了各种流言和事件。　　美丽的蔷薇长着刺，女人的花园里到处是毒，总是少不了的流言与阴谋。　　尽管麻烦，猫猫还是处理着壬氏不断地推给她的各种工作。　　难得一见的爱毒少女今天也在后宫里跑来跑去。

这是一个人类理所当然拥有超能力“个性”的世界。被称为「笨久」的“无个性”少年·绿谷出久与憧憬的No.1英雄欧尔麦特相遇，被其发现绿谷隐藏的英雄资质，从欧尔麦特手中继承了“个性” One For All。笨久进入了英雄辈出的名门高中·雄英高中，以成为用“个性”拯救社会和人们的英雄为目标，和同学们一起度过了充满考验的每一天。 虽然打倒了宿敌All For One，但欧尔麦特也用尽了力量，便从职业英雄隐退。笨久继承了他的遗志，拿到了「职业英雄临时执照」，又接近了“最棒的英雄”一步。这时，笨久遇见了雄英三巨头中的一位，在职业英雄夜目爵士手下进行校外实习的三年级学生·通形未吏生。其压倒性的实力，让笨久更加向往在职业英雄事务所参加可以真正进行英雄活动的校外实习。另一边，不安分的＜Villain＞团体·死秽八斋会的年轻头领解修师，与继承了All For One意志的敌人＜Villain＞联军首领死柄木吊进行了接触。之后，在解修师的身旁，出现了一位少女的身影。 笨久与英雄候补生们即将与新的 “威胁” 进行战斗，新的 “使命” 挑战也开始了！！

　　RIDER KABUTO是幪面超人诞生35周年纪念作品，采用昔日昆虫(巨型甲虫角日语KABUTOMUSHI)的设计，配合如幪面超人555般充满金属机械感，当中新颖的战斗场面采用了有如Matrix的拍摄手法，大量CG增加了速度感及观感， KABUTO的技能及必杀，更显其更潇酒有型。　　故事讲述涉谷被掉下的宇宙硕石毁灭，七年后出现的宇宙生物WORM四处杀害人类，纵使日本特别组织ZECT出动也徒然，成员加贺美新知道只有开发的腰带能与宇宙生物匹敌，但给拥有静头脑且身手敏捷的天道总司，取得甲虫形态KABUTO ZECTOR的控制权变身幪面超人KABUTO把WORM打败。　　随着七年前与岩石掉下毁灭涉谷的宇宙生物WORM，基本形态为绿色的「蛹」，统一的外貌有一双手掩盖面孔，遇见过的人类便能模拟对方面貌、行为及声音，在人类社会杀害及侵略活动，纵使ZECT军事武器也未能使WORM损伤。从「蛹」进化脱皮为成虫，而外貌变化各有不同，活动及破坏能力也大大提升，并可进行超越人类感知能力的加速运动性，此现象被称为「CLOCK UP」。

　　住在意大利那不勒斯的青年乔鲁诺·乔巴拿，是继承了乔斯达家宿敌·DIO之血脉的儿子。　　幼年时遭受迫害而自暴自弃的他，由于拯救了一名黑帮男子，而学到了“相信他人”。不忘恩义、带着敬意对待自己的黑帮，让他的心变得率直。就这样，乔鲁诺开始对“黑帮明星”怀有憧憬。15岁的乔鲁诺，与统领意大利黑社会的黑帮组织“热情”一同引发事端，并成为被盯上的目标……

羽鸟智世（种崎敦美 配音）表面看来只是一个略微冷淡的平凡少女，实际上却隐藏着可怜的身世。年幼时，智世的母亲自杀，父亲离家出走，无处可去的他在十五岁那一年成为了商品被地下拍卖会组织卖给了名为艾利亚斯（竹内良太 配音）的魔法使。其实，智世拥有着夜之宠儿的特殊体质，能够在无意识之中吸收外界所散发的魔力，是十分稀有的物种。　　智世成为了艾利亚斯的助手，利用自己的超能力帮助艾利亚斯解决教会委托的任务。在此过程中，艾利亚斯的温柔和体贴不断的治愈着智世的内心，智世也渐渐学会了使用自己的能力去将周遭的世界改变的更加美好。