地处新香港市的一个喧嚣夜晚，一度沉缅立体格斗的美剑阳菜(池泽春菜 配音）和夏树、惠美正在巨蛋体育馆观看精彩纷呈的异种格斗，突然之间体育馆内出现剧烈爆炸。阳菜从短暂的昏迷中醒来，发现自己被号称GOMA四天王之一的真红之莎菲亚摄入一个异度空间。危急时刻，冷静沉着的仙蒂·撒哈尼（桑岛法子 配音）出面拯救了她。连番激战过后，阳菜体内蕴含的力量觉醒，实现变身。随后，凤丽华（木村亜希子 配音）也加入战斗中。另一方面，阳菜的父亲随某考古学家探究远古文明的秘密，无意中启动了古文明的动力装置。世界开始面临前所未有的改变……　　本片根据大张正己和青树零梦的原作改编。

自从击退了艾尔莎等人的袭击，并在和大兔的战斗中与碧翠丝签订契约，从而解放了“圣域”后，已经过了一年。

君主制国家威斯帕尼亚王国因发现奇妙的矿石而引起世界关注，然而此时却发生悲惨事件，该国女王萨克拉?阿尔蒂亚和王子吉尔?加乌尔突发意外身亡。公主米拉?朱丽叶拒绝继承王位，与此同时国内也掀起反对米拉合要求取消君主制的狂潮。在这种纷乱的情况下，米拉和奇斯伯爵出访日本。在公主的欢迎宴会上，米兰险遭暗算，无法忍受这一切的她偷偷逃了出去，却在日本街头遭遇与自己长相一样的小兰，渴望正常人生活的米拉于是和小兰互换了身份。倍感蹊跷的柯南偷偷展开调查，而另一方面，大盗鲁邦三世潜入威斯帕尼亚企图偷窃该国世代相传的钻石王冠。事态变得混乱起来……　　本片为日本电视台开播55周年和读卖电视台开播50周年共同纪念作品。

　　魔法世界，托里斯特因魔法学院，年轻人在这里学习魔法课程。　　刚刚升入2年级的少女露易兹•德拉•瓦里埃尔因为一直以来施法成功率为0，被大家戏称为“零之露易兹”，她每次施法都无法成功，反而引起爆炸，把学院正常的学习生活搞的一团糟。　　这一天，是魔法师一生一次的使魔召唤仪式，召唤的使魔将会与魔法师永远在一起。其他学生都顺利完成了使魔的召唤，而露易兹咒语一出，毫无意外的发生了爆炸。不过，露易兹还是召唤出了一个使魔——一位人类！东京的少年才人竟然来到了魔法世界，并被当作一位使魔！　　不知所措的才人与不把才人当人看的露易兹签订了契约，在这个魔法学院，东京的普通少年才人，他的命运会怎么样呢。

作为实现愿望的代价，在无人知晓的情况下不断战斗的魔法少女们。然而，环伊吕波，却忘记了自己的愿望。“成为魔法少女的时候，我是许了什么愿望来着？”日常当中突然出现的空洞。失去了的某件重要之物。连理由都不知道，就这样每天不停地战斗……　　就在此时，魔法少女之间开始流传某个传闻。“若能去神滨的话，魔法少女就能得到拯救”。魔法少女与传闻集中的城市，神滨市。寻求着自己失去的愿望，环伊吕波的故事开始了——