- 当第五季结束时，Piper等10名囚犯遭到全副武装的特警的围攻，流血冲突一触即发。与此同时，其他囚犯将被运送到其他监狱。第六季故事起始于「特警围攻」事件一周后，Litchfield监狱的暴乱遭到镇压，被重新抓获的囚犯们被迫在新的环境中适应新的规矩。暴乱事件的主犯全都被关押在戒备森严的「Litchfield Max」监狱。Taystee的情况最糟糕，她要求为Poussey之死寻求正义，但现在她却因Piscatella和Humphrey的死而遭到正式调查。监狱中的权力发生变化，刑期大幅延长，以前度假一般的生活不复存在。原本高高在上的「囚犯首领」，现在成了「底层人物」，不仅遭到其他囚犯的虐待，还遭到狱警的折磨。友谊面临考验，新的合作关系正在形成——有些是自愿的，有些则是受环境所迫。当局对参与暴乱的囚犯单独关押、单独审讯。并开出了诱人的认罪条件，导致她们产生内部分裂。是为了寻求自保和减少刑期而背叛朋友，还是坚持友谊至上而保持团结？ 现在最重要的问题是……Alex去哪儿了？
- 杰森·伯恩事件引起连锁反应，踏脚石（Treadstone）计划以及CIA用药物控制强化特工的行径通过报纸公之于众，令其幕后人物坐立不安。为了阻止满盘皆输的局面出现，CIA高层决定中止该计划，并将相关特工人员以及科学家从行动中抹杀。在此后的日子里，那些深藏在国家政治最底层、依靠蓝绿药丸执行各种绝密任务的特工相继殒命，而负责染脏双手的执行人——前美国空军上校艾瑞克·贝尔（爱德华·诺顿 Edward Norton 饰），正慢慢将屠刀伸向隐藏在位于阿拉斯加崇山峻岭、暴雪深山中的特工艾伦·克劳斯（杰瑞米·雷纳 Jeremy Renner 饰）。 突如其来的炮火袭击令艾伦意识到自己所处的危险境地，在之后的日子里，他不仅要在昔日同伴的追杀中求生，还必须设法找到那曾为他提供源源不断体能和智力的蓝绿药丸……
