The legacy of the fastest man in history, Usain Bolt.

冷子峰原为拳击界冉冉升起的新星，却在遇见了出身击剑世家的赵伊虹之后，改变了人生的方向。为了实现击剑梦想，两人一起加入了击剑强校震宇学院。起初，新手子峰和没有天份的伊虹一度在队伍里垫底。为了得到主将的肯定，两人互相扶持，努力克服了严苛地训练。冷子峰成为了最具潜力的击剑黑马，而赵伊虹成为了百战百胜的战略智囊。正当两人准备携手进入国家集训队，立志为国争光之时，意外地牵扯出二十年前的恩怨。原来冷子峰的父亲也曾是击剑国手，却被赵伊虹的父亲挟私怨所伤，黯然退出击剑界，隐姓埋名至今。国际赛上，强敌压境，在国家荣誉面前，两人最终放下了芥蒂，携手全力拼搏，为国家荣誉而战，也为彼此的真心而战。

身为高中数学老师的犬冢公平（中村悠一 配音）的妻子去世，留下五岁的女儿犬冢䌷希（远藤璃菜 配音）的父亲相依为命。善良而又负责的公平细心的呵护着女儿，却独独在做饭这件事情上力不从心，父女两人只得用外卖来应付一日三餐。

前作の主人公・円堂守ら率いる日本代表選手「イナズマジャパン」がFFI世界大会で優勝した10年後、松風天馬はそんな円堂らイナズマイレブンに憧れ、雷門中学校に入学し、雷門サッカー部に入部。しかし、サッカーは腐敗し、あの頃の熱いサッカーはどこにもなかった。突然、渦巻く暗雲に巻き込まれていく天馬たち。それが悲劇の始まりであった。あの頃のサッカーを取り戻すため、雷門イレブンが雷門サッカー部の監督となった円堂と共に立ち上がる…!

第三期 银河　　时空之石事件之后，在圣光之路大赛足球场即将举办全新闪电日本选拔，在获选的选手中，除了天马、剑城以及神童外，全是在其他学校首次踢球的运动选手，他们要如何整顿球队迎接世界的挑战呢？　　此队与剧场版《闪电十一人GO VS纸箱战机》的新生闪电日本队并无关系，是由黑岩监督亲自从日本挑选而组成的球队。　　除了雷门的三巨头外，其他八名都是从参加神圣之路的队伍的板凳里选出来，且八人均是踢足球的新手。　　目前新生闪电日本队没有板凳成员。　　在世界大赛中禁止使用化身（所以更别说极限和体了）。