The third season began on March 14, 2009 with the three-part premiere, Transwarped, and ended on May 23, 2009. This season following the events of Transwarped focused on the Autobots' attempt to reach Cybertron in order to warn the Autobot High Council of Shockwave, who has been masquerading as Autobot Intelligence Officer Longarm Prime. Meanwhile, Megatron, Starscream, Shockwave (who replaces Blitzwing as a main character), and Lugnut plan to use the colossal Autobot Omega Supreme for constructing clones of him (dubbed as Lugnut Supremes, as they appear similar to Lugnut).

克里斯蒂安（迈克尔·梅尔坦斯 Michael Maertens 饰）是一名才华横溢的自由摄影师，而他的女朋友安妮（安格拉·夏娜莱克 Angela Schanelec 饰）则在植物园工作，两人交往多年，彼此之间的感情十分的稳定。某日，克里斯蒂安结识了安妮同父异母的姐姐伊莎贝尔（Margit Bendokat 饰），他深深的被这个女人吸引了。　　坠入情网之中无法自拔的克里斯蒂安想要和安妮分手，并且搬走去和伊莎贝尔同住，这让深深的爱着克里斯蒂安的安妮感到非常的崩溃。为了挽留克里斯蒂安，安妮想尽了一切方法，甚至去找伊莎贝尔交涉，然而，安妮能够短暂的留住克里斯蒂安，却无法留住他的心。

暑假到了，双胞胎姐弟俩梅宝（克里斯汀·沙尔 Kristen Schaal 配音）和迪普（杰森·雷特 Jason Ritter 配音）被爸妈赶到一个偏僻小镇“重力泉”过暑假，在这里，他们的斯坦叔公经营着一家专门敲诈游客的旅游景点“神秘小屋”，其中有着各种各样稀奇古怪的东西。然而更让人感到毛骨悚然的，则是这个怪诞小镇里的森林。为人慎重、头脑聪明的迪普觉察到森林的异样，继而发现了一本埋在地下的神秘笔记本，里面记载着存在于神秘小镇的不为人知的秘密。乐天派的梅宝和机智的迪普，结识了神秘小屋的店员温蒂和苏斯，还遇到各种奇妙的小镇居民。在怪诞小镇重力泉，他们经历了一系列奇异事件，小矮人，湖怪，蜡像，通灵者，他们这个暑假注定不平凡。

1940年5月，德国入侵荷兰，荷兰青年奋起反抗，以皮特·哈提克为首组成了秘密的抵抗军。德军不仅压迫荷兰人民，更残忍地对犹太人实施种族灭绝政策。德军首领拉曼是个冷血的人，他酷爱收藏，这次他又有了一个大的计划，“收藏”孤儿院的犹太儿童。得知消息的抵抗军迅速行动，伪装成德军用卡车救出了这些孩子。皮特为了寻找一个失踪的孩子露达被捕，最后牺牲。二战期间荷兰人民建立的安全屋拯救了大批的犹太人。无数年轻生命的牺牲换来了荷兰的解放。

　　铃木奈未（上白石萌音 饰）是一个凡是都追求“差不多”的佛系女孩，无论是工作还是恋情，铃木对自己的要求都是只要做到差不多即可。铃木有一个暗恋多年的青梅竹马名叫健也，他生活在繁华的大都市东京。为了追逐男神的脚步，铃木也只身一人来到东京求职，并且最终顺利的成为了一家有名的出版社里的编辑。　　让铃木没有想到的是，自己的上司宝来丽子（菜菜绪 饰）是一个个性非常极端的工作狂，力求在一切事务上都做到极致。在丽子的领导之下，铃木在职场上的每一天都过得非常艰难。幸运的是，出版社的摄影师润之介（玉森裕太 饰）一直支持和鼓励着铃木，随着时间的推移，青涩的爱恋在两人之间缓慢孵化